Los chapulines (langostas) y caracoles pueden ser un problema serio para cualquier almácigo de hortalizas, ya que mastican los tallos tiernos de los plantines. Los gusanos también pueden causar daño, pero más en el tomate y en el repollo que en el chile o ají. Para proteger los cultivos jóvenes, muchos agricultores usan plaguicidas. Los plaguicidas son caros, y peligrosos para la salud de los productores, los consumidores y el medio ambiente. Se puede proteger a los plantines de las plagas y de los animales, tapándolos con una red contra insectos.